Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pold1P52431 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pold1P52431 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pold1P52431 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pold1P52431 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pold1P52431 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pold1P52431 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pold1P52431 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pold1P52431 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pold1P52431 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pold1P52431 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pold1P52431 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pold1P52431 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pold1P52431 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pold1P52431 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pold1P52431 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pold1P52431 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pold1P52431 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pold1P52431 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pold1P52431 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pold1P52431 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pold1P52431 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pold1P52431 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms