Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RorcP51450 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RorcP51450 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RorcP51450 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RorcP51450 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RorcP51450 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RorcP51450 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RorcP51450 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RorcP51450 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RorcP51450 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RorcP51450 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RorcP51450 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RorcP51450 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RorcP51450 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RorcP51450 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RorcP51450 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RorcP51450 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RorcP51450 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RorcP51450 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RorcP51450 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorcP51450 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorcP51450 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorcP51450 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorcP51450 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorcP51450 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorcP51450 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorcP51450 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorcP51450 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RorcP51450 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorcP51450 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorcP51450 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorcP51450 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorcP51450 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorcP51450 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorcP51450 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorcP51450 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorcP51450 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorcP51450 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorcP51450 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RorcP51450 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorcP51450 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorcP51450 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorcP51450 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorcP51450 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RorcP51450 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorcP51450 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorcP51450 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RorcP51450 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorcP51450 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorcP51450 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorcP51450 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorcP51450 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorcP51450 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorcP51450 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorcP51450 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RorcP51450 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RorcP51450 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RorcP51450 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RorcP51450 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RorcP51450 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RorcP51450 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RorcP51450 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RorcP51450 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RorcP51450 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RorcP51450 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RorcP51450 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RorcP51450 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RorcP51450 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RorcP51450 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RorcP51450 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RorcP51450 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RorcP51450 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RorcP51450 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RorcP51450 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RorcP51450 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RorcP51450 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RorcP51450 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RorcP51450 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RorcP51450 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorcP51450 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorcP51450 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorcP51450 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorcP51450 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RorcP51450 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorcP51450 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorcP51450 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorcP51450 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorcP51450 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RorcP51450 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorcP51450 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RorcP51450 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RorcP51450 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RorcP51450 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RorcP51450 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RorcP51450 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RorcP51450 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RorcP51450 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RorcP51450 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RorcP51450 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RorcP51450 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms