Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MipP51180 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MipP51180 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MipP51180 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MipP51180 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MipP51180 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MipP51180 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MipP51180 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MipP51180 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MipP51180 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MipP51180 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MipP51180 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MipP51180 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MipP51180 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MipP51180 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MipP51180 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MipP51180 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MipP51180 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MipP51180 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MipP51180 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MipP51180 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MipP51180 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MipP51180 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MipP51180 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MipP51180 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MipP51180 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MipP51180 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MipP51180 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MipP51180 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MipP51180 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MipP51180 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MipP51180 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MipP51180 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MipP51180 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MipP51180 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MipP51180 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MipP51180 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MipP51180 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MipP51180 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MipP51180 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MipP51180 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MipP51180 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MipP51180 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MipP51180 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MipP51180 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MipP51180 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MipP51180 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MipP51180 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MipP51180 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MipP51180 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MipP51180 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MipP51180 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MipP51180 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MipP51180 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MipP51180 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MipP51180 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MipP51180 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MipP51180 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MipP51180 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MipP51180 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MipP51180 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MipP51180 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MipP51180 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MipP51180 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MipP51180 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MipP51180 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MipP51180 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MipP51180 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MipP51180 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MipP51180 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MipP51180 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MipP51180 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MipP51180 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MipP51180 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MipP51180 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MipP51180 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MipP51180 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MipP51180 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MipP51180 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MipP51180 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MipP51180 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MipP51180 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MipP51180 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MipP51180 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MipP51180 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MipP51180 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MipP51180 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MipP51180 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MipP51180 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MipP51180 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MipP51180 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MipP51180 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MipP51180 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MipP51180 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MipP51180 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MipP51180 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MipP51180 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MipP51180 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MipP51180 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MipP51180 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms