Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtpreP49446 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpreP49446 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpreP49446 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtpreP49446 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtpreP49446 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpreP49446 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PtpreP49446 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtpreP49446 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtpreP49446 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtpreP49446 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtpreP49446 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpreP49446 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpreP49446 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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