Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CitP49025 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CitP49025 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CitP49025 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CitP49025 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CitP49025 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CitP49025 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CitP49025 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CitP49025 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CitP49025 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CitP49025 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CitP49025 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CitP49025 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CitP49025 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CitP49025 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CitP49025 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CitP49025 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CitP49025 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CitP49025 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CitP49025 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CitP49025 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CitP49025 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CitP49025 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CitP49025 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CitP49025 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CitP49025 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CitP49025 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CitP49025 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CitP49025 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CitP49025 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CitP49025 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CitP49025 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CitP49025 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CitP49025 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CitP49025 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CitP49025 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CitP49025 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CitP49025 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CitP49025 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CitP49025 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CitP49025 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CitP49025 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CitP49025 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CitP49025 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CitP49025 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CitP49025 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CitP49025 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CitP49025 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CitP49025 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CitP49025 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CitP49025 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CitP49025 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CitP49025 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CitP49025 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CitP49025 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CitP49025 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CitP49025 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CitP49025 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CitP49025 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CitP49025 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CitP49025 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CitP49025 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CitP49025 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CitP49025 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CitP49025 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CitP49025 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CitP49025 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CitP49025 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CitP49025 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CitP49025 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CitP49025 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CitP49025 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CitP49025 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CitP49025 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CitP49025 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CitP49025 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CitP49025 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CitP49025 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CitP49025 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CitP49025 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CitP49025 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CitP49025 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CitP49025 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CitP49025 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CitP49025 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CitP49025 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CitP49025 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CitP49025 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CitP49025 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CitP49025 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CitP49025 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CitP49025 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CitP49025 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CitP49025 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CitP49025 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CitP49025 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CitP49025 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CitP49025 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CitP49025 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CitP49025 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms