Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gli1P47806 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gli1P47806 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gli1P47806 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gli1P47806 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gli1P47806 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gli1P47806 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gli1P47806 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gli1P47806 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gli1P47806 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gli1P47806 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gli1P47806 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gli1P47806 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gli1P47806 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms