Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax9P47242 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax9P47242 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax9P47242 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax9P47242 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax9P47242 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax9P47242 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax9P47242 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax9P47242 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pax9P47242 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms