Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms