Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf2P39429 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf2P39429 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf2P39429 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf2P39429 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Traf2P39429 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf2P39429 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf2P39429 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf2P39429 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf2P39429 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms