Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf1P39428 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf1P39428 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf1P39428 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf1P39428 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf1P39428 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf1P39428 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms