Protein–RNA interactions for Protein: P38649

Abo, Histo-blood group ABO system transferase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AboP38649 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AboP38649 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AboP38649 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AboP38649 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AboP38649 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AboP38649 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AboP38649 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AboP38649 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AboP38649 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AboP38649 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AboP38649 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
AboP38649 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AboP38649 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AboP38649 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AboP38649 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AboP38649 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AboP38649 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AboP38649 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AboP38649 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AboP38649 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AboP38649 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AboP38649 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AboP38649 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AboP38649 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AboP38649 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AboP38649 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AboP38649 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AboP38649 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AboP38649 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AboP38649 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AboP38649 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AboP38649 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AboP38649 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AboP38649 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AboP38649 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AboP38649 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AboP38649 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AboP38649 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AboP38649 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AboP38649 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AboP38649 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AboP38649 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AboP38649 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AboP38649 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AboP38649 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AboP38649 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AboP38649 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AboP38649 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AboP38649 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AboP38649 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AboP38649 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AboP38649 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AboP38649 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AboP38649 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AboP38649 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AboP38649 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AboP38649 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AboP38649 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AboP38649 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AboP38649 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AboP38649 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AboP38649 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AboP38649 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AboP38649 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AboP38649 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AboP38649 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AboP38649 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
AboP38649 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AboP38649 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AboP38649 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AboP38649 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AboP38649 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AboP38649 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AboP38649 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AboP38649 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AboP38649 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AboP38649 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AboP38649 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AboP38649 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AboP38649 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AboP38649 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AboP38649 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AboP38649 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AboP38649 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AboP38649 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AboP38649 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AboP38649 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AboP38649 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AboP38649 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AboP38649 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AboP38649 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AboP38649 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AboP38649 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AboP38649 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AboP38649 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AboP38649 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AboP38649 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AboP38649 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AboP38649 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AboP38649 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms