Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rfc1P35601 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rfc1P35601 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms