Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6dP35459 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms