Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Grin2aP35436 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Grin2aP35436 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Grin2aP35436 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms