Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TpoP35419 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TpoP35419 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TpoP35419 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TpoP35419 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TpoP35419 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TpoP35419 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TpoP35419 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TpoP35419 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TpoP35419 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TpoP35419 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TpoP35419 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TpoP35419 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TpoP35419 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TpoP35419 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TpoP35419 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TpoP35419 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TpoP35419 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TpoP35419 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TpoP35419 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TpoP35419 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TpoP35419 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TpoP35419 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TpoP35419 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TpoP35419 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TpoP35419 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TpoP35419 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TpoP35419 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TpoP35419 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TpoP35419 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TpoP35419 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TpoP35419 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TpoP35419 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TpoP35419 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TpoP35419 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TpoP35419 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TpoP35419 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TpoP35419 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TpoP35419 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TpoP35419 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TpoP35419 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TpoP35419 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TpoP35419 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TpoP35419 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TpoP35419 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TpoP35419 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TpoP35419 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TpoP35419 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TpoP35419 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TpoP35419 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TpoP35419 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TpoP35419 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TpoP35419 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TpoP35419 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TpoP35419 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TpoP35419 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TpoP35419 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TpoP35419 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TpoP35419 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TpoP35419 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TpoP35419 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TpoP35419 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TpoP35419 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TpoP35419 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TpoP35419 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TpoP35419 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TpoP35419 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TpoP35419 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TpoP35419 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TpoP35419 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TpoP35419 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TpoP35419 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TpoP35419 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TpoP35419 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TpoP35419 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TpoP35419 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TpoP35419 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TpoP35419 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TpoP35419 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TpoP35419 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TpoP35419 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TpoP35419 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TpoP35419 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TpoP35419 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TpoP35419 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TpoP35419 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TpoP35419 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TpoP35419 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TpoP35419 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TpoP35419 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TpoP35419 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TpoP35419 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TpoP35419 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TpoP35419 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TpoP35419 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TpoP35419 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TpoP35419 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TpoP35419 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TpoP35419 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TpoP35419 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms