Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptk2P34152 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms