Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxa11P31311 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms