Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms