Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PdgfraP26618 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms