Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CftrP26361 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
CftrP26361 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CftrP26361 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CftrP26361 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CftrP26361 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CftrP26361 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CftrP26361 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CftrP26361 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CftrP26361 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CftrP26361 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CftrP26361 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CftrP26361 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CftrP26361 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CftrP26361 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CftrP26361 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CftrP26361 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CftrP26361 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CftrP26361 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CftrP26361 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CftrP26361 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CftrP26361 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CftrP26361 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CftrP26361 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CftrP26361 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
CftrP26361 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CftrP26361 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CftrP26361 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CftrP26361 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
CftrP26361 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CftrP26361 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CftrP26361 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
CftrP26361 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CftrP26361 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CftrP26361 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CftrP26361 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CftrP26361 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CftrP26361 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CftrP26361 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CftrP26361 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CftrP26361 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CftrP26361 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CftrP26361 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CftrP26361 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CftrP26361 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CftrP26361 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CftrP26361 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CftrP26361 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CftrP26361 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CftrP26361 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CftrP26361 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CftrP26361 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CftrP26361 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CftrP26361 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CftrP26361 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CftrP26361 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CftrP26361 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CftrP26361 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CftrP26361 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CftrP26361 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CftrP26361 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CftrP26361 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CftrP26361 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CftrP26361 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CftrP26361 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CftrP26361 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CftrP26361 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CftrP26361 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CftrP26361 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CftrP26361 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CftrP26361 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CftrP26361 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CftrP26361 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CftrP26361 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CftrP26361 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CftrP26361 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CftrP26361 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CftrP26361 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CftrP26361 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CftrP26361 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CftrP26361 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CftrP26361 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CftrP26361 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CftrP26361 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CftrP26361 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CftrP26361 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CftrP26361 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CftrP26361 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CftrP26361 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CftrP26361 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CftrP26361 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CftrP26361 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CftrP26361 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CftrP26361 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CftrP26361 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CftrP26361 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
CftrP26361 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CftrP26361 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CftrP26361 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CftrP26361 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms