Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb7P26011 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb7P26011 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itgb7P26011 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms