Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfrsf1bP25119 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf1bP25119 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms