Protein–RNA interactions for Protein: P23906

Irf2, Interferon regulatory factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2P23906 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf2P23906 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf2P23906 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf2P23906 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf2P23906 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf2P23906 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irf2P23906 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms