Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gria1P23818 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gria1P23818 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gria1P23818 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gria1P23818 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gria1P23818 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gria1P23818 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gria1P23818 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gria1P23818 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms