Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RarbP22605 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RarbP22605 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RarbP22605 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RarbP22605 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RarbP22605 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RarbP22605 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RarbP22605 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RarbP22605 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RarbP22605 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RarbP22605 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RarbP22605 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RarbP22605 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RarbP22605 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RarbP22605 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RarbP22605 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RarbP22605 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RarbP22605 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RarbP22605 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RarbP22605 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RarbP22605 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RarbP22605 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RarbP22605 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RarbP22605 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RarbP22605 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RarbP22605 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RarbP22605 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RarbP22605 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RarbP22605 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RarbP22605 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RarbP22605 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RarbP22605 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RarbP22605 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RarbP22605 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RarbP22605 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RarbP22605 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RarbP22605 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RarbP22605 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RarbP22605 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RarbP22605 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RarbP22605 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RarbP22605 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RarbP22605 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RarbP22605 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RarbP22605 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RarbP22605 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RarbP22605 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RarbP22605 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RarbP22605 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RarbP22605 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RarbP22605 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RarbP22605 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RarbP22605 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RarbP22605 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RarbP22605 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RarbP22605 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RarbP22605 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RarbP22605 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RarbP22605 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RarbP22605 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RarbP22605 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RarbP22605 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RarbP22605 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RarbP22605 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RarbP22605 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RarbP22605 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RarbP22605 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RarbP22605 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RarbP22605 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RarbP22605 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RarbP22605 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RarbP22605 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RarbP22605 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RarbP22605 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RarbP22605 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RarbP22605 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RarbP22605 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RarbP22605 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RarbP22605 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RarbP22605 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RarbP22605 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RarbP22605 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RarbP22605 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RarbP22605 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RarbP22605 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RarbP22605 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RarbP22605 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RarbP22605 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RarbP22605 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RarbP22605 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RarbP22605 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RarbP22605 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RarbP22605 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RarbP22605 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RarbP22605 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RarbP22605 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RarbP22605 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RarbP22605 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RarbP22605 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RarbP22605 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms