Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnc2P20801 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms