Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prim1P20664 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prim1P20664 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prim1P20664 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prim1P20664 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prim1P20664 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prim1P20664 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prim1P20664 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Prim1P20664 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prim1P20664 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prim1P20664 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms