Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefhP19246 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NefhP19246 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefhP19246 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefhP19246 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefhP19246 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefhP19246 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefhP19246 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefhP19246 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefhP19246 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefhP19246 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefhP19246 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefhP19246 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefhP19246 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NefhP19246 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefhP19246 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefhP19246 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefhP19246 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefhP19246 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefhP19246 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefhP19246 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefhP19246 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefhP19246 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NefhP19246 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NefhP19246 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NefhP19246 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NefhP19246 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NefhP19246 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NefhP19246 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NefhP19246 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NefhP19246 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NefhP19246 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NefhP19246 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NefhP19246 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NefhP19246 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NefhP19246 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NefhP19246 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NefhP19246 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NefhP19246 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NefhP19246 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NefhP19246 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NefhP19246 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NefhP19246 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NefhP19246 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NefhP19246 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NefhP19246 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NefhP19246 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NefhP19246 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NefhP19246 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NefhP19246 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NefhP19246 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NefhP19246 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NefhP19246 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NefhP19246 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NefhP19246 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NefhP19246 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NefhP19246 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NefhP19246 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NefhP19246 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NefhP19246 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NefhP19246 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NefhP19246 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NefhP19246 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NefhP19246 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NefhP19246 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NefhP19246 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NefhP19246 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NefhP19246 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NefhP19246 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NefhP19246 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NefhP19246 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NefhP19246 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NefhP19246 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NefhP19246 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NefhP19246 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NefhP19246 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NefhP19246 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NefhP19246 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NefhP19246 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NefhP19246 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NefhP19246 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NefhP19246 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NefhP19246 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NefhP19246 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NefhP19246 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NefhP19246 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NefhP19246 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NefhP19246 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NefhP19246 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NefhP19246 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NefhP19246 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NefhP19246 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NefhP19246 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NefhP19246 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NefhP19246 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NefhP19246 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NefhP19246 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NefhP19246 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefhP19246 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefhP19246 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms