Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CnpP16330 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CnpP16330 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CnpP16330 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CnpP16330 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CnpP16330 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CnpP16330 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CnpP16330 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CnpP16330 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CnpP16330 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CnpP16330 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CnpP16330 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CnpP16330 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CnpP16330 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CnpP16330 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CnpP16330 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CnpP16330 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CnpP16330 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CnpP16330 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CnpP16330 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CnpP16330 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CnpP16330 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CnpP16330 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CnpP16330 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CnpP16330 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CnpP16330 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CnpP16330 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CnpP16330 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CnpP16330 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CnpP16330 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CnpP16330 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CnpP16330 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CnpP16330 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CnpP16330 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CnpP16330 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CnpP16330 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CnpP16330 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CnpP16330 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CnpP16330 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CnpP16330 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CnpP16330 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CnpP16330 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CnpP16330 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CnpP16330 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CnpP16330 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CnpP16330 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CnpP16330 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CnpP16330 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CnpP16330 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CnpP16330 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CnpP16330 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CnpP16330 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CnpP16330 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CnpP16330 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CnpP16330 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CnpP16330 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CnpP16330 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CnpP16330 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CnpP16330 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CnpP16330 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CnpP16330 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CnpP16330 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CnpP16330 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CnpP16330 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CnpP16330 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CnpP16330 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CnpP16330 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CnpP16330 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CnpP16330 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CnpP16330 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CnpP16330 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CnpP16330 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CnpP16330 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CnpP16330 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CnpP16330 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CnpP16330 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CnpP16330 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CnpP16330 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CnpP16330 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CnpP16330 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CnpP16330 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CnpP16330 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CnpP16330 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CnpP16330 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CnpP16330 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CnpP16330 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CnpP16330 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CnpP16330 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CnpP16330 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CnpP16330 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CnpP16330 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CnpP16330 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CnpP16330 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CnpP16330 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CnpP16330 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CnpP16330 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CnpP16330 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CnpP16330 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CnpP16330 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CnpP16330 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms