Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrphP15331 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrphP15331 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrphP15331 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrphP15331 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrphP15331 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrphP15331 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrphP15331 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrphP15331 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrphP15331 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PrphP15331 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrphP15331 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrphP15331 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrphP15331 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrphP15331 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrphP15331 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrphP15331 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrphP15331 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrphP15331 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrphP15331 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrphP15331 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrphP15331 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrphP15331 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrphP15331 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrphP15331 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrphP15331 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrphP15331 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrphP15331 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrphP15331 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrphP15331 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrphP15331 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrphP15331 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrphP15331 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrphP15331 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrphP15331 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrphP15331 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrphP15331 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrphP15331 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrphP15331 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrphP15331 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrphP15331 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrphP15331 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PrphP15331 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrphP15331 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrphP15331 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrphP15331 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrphP15331 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrphP15331 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrphP15331 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrphP15331 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrphP15331 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrphP15331 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrphP15331 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrphP15331 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrphP15331 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrphP15331 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrphP15331 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrphP15331 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrphP15331 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrphP15331 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrphP15331 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrphP15331 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrphP15331 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrphP15331 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrphP15331 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrphP15331 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrphP15331 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrphP15331 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrphP15331 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrphP15331 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrphP15331 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrphP15331 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrphP15331 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrphP15331 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PrphP15331 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrphP15331 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrphP15331 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrphP15331 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrphP15331 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrphP15331 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrphP15331 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrphP15331 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrphP15331 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrphP15331 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PrphP15331 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrphP15331 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrphP15331 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrphP15331 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrphP15331 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrphP15331 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrphP15331 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrphP15331 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrphP15331 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrphP15331 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrphP15331 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrphP15331 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrphP15331 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrphP15331 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrphP15331 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrphP15331 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms