Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmnb1P14733 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmnb1P14733 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms