Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-Q9P14431 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-Q9P14431 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-Q9P14431 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-Q9P14431 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-Q9P14431 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-Q9P14431 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-Q9P14431 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-Q9P14431 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-Q9P14431 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-Q9P14431 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-Q9P14431 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Q9P14431 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-Q9P14431 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-Q9P14431 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-Q9P14431 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Q9P14431 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Q9P14431 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Q9P14431 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms