Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Dnmt1P13864 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Dnmt1P13864 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Dnmt1P13864 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms