Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timp1P12032 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timp1P12032 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timp1P12032 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timp1P12032 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timp1P12032 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timp1P12032 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timp1P12032 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timp1P12032 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timp1P12032 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timp1P12032 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timp1P12032 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Timp1P12032 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Timp1P12032 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timp1P12032 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timp1P12032 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Timp1P12032 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timp1P12032 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Timp1P12032 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timp1P12032 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timp1P12032 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms