Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DmdP11531 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DmdP11531 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DmdP11531 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DmdP11531 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DmdP11531 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DmdP11531 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DmdP11531 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DmdP11531 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DmdP11531 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DmdP11531 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DmdP11531 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DmdP11531 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DmdP11531 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DmdP11531 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DmdP11531 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DmdP11531 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DmdP11531 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DmdP11531 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
DmdP11531 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DmdP11531 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DmdP11531 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DmdP11531 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DmdP11531 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DmdP11531 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DmdP11531 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DmdP11531 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DmdP11531 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DmdP11531 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DmdP11531 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DmdP11531 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DmdP11531 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DmdP11531 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DmdP11531 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DmdP11531 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DmdP11531 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DmdP11531 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DmdP11531 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DmdP11531 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DmdP11531 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DmdP11531 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DmdP11531 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DmdP11531 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DmdP11531 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DmdP11531 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DmdP11531 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DmdP11531 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DmdP11531 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DmdP11531 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DmdP11531 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DmdP11531 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DmdP11531 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DmdP11531 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DmdP11531 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DmdP11531 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DmdP11531 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DmdP11531 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DmdP11531 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DmdP11531 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DmdP11531 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DmdP11531 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DmdP11531 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DmdP11531 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DmdP11531 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DmdP11531 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DmdP11531 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DmdP11531 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DmdP11531 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DmdP11531 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DmdP11531 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DmdP11531 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DmdP11531 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DmdP11531 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DmdP11531 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DmdP11531 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DmdP11531 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DmdP11531 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DmdP11531 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DmdP11531 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DmdP11531 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DmdP11531 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DmdP11531 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DmdP11531 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DmdP11531 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DmdP11531 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DmdP11531 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DmdP11531 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DmdP11531 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DmdP11531 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DmdP11531 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DmdP11531 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DmdP11531 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DmdP11531 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DmdP11531 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DmdP11531 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DmdP11531 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DmdP11531 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DmdP11531 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DmdP11531 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DmdP11531 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms