Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms