Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CatspereP0DP43 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms