Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Amd1P0DMN7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms