Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3P09920 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3P09920 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3P09920 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3P09920 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3P09920 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3P09920 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3P09920 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3P09920 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf3P09920 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms