Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifna5P07349 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms