Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtrP07309 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtrP07309 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtrP07309 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TtrP07309 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtrP07309 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtrP07309 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtrP07309 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtrP07309 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtrP07309 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtrP07309 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtrP07309 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtrP07309 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtrP07309 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtrP07309 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtrP07309 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtrP07309 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtrP07309 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtrP07309 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtrP07309 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtrP07309 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtrP07309 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtrP07309 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtrP07309 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtrP07309 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtrP07309 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtrP07309 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtrP07309 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtrP07309 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TtrP07309 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtrP07309 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtrP07309 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TtrP07309 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TtrP07309 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TtrP07309 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TtrP07309 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TtrP07309 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TtrP07309 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtrP07309 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtrP07309 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtrP07309 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtrP07309 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtrP07309 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtrP07309 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TtrP07309 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TtrP07309 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TtrP07309 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TtrP07309 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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TtrP07309 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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TtrP07309 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TtrP07309 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TtrP07309 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TtrP07309 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TtrP07309 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TtrP07309 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TtrP07309 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TtrP07309 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TtrP07309 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TtrP07309 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TtrP07309 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TtrP07309 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TtrP07309 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TtrP07309 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TtrP07309 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TtrP07309 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TtrP07309 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TtrP07309 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TtrP07309 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TtrP07309 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TtrP07309 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TtrP07309 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TtrP07309 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TtrP07309 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TtrP07309 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TtrP07309 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TtrP07309 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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