Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csf1P07141 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Csf1P07141 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csf1P07141 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csf1P07141 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf1P07141 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf1P07141 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf1P07141 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf1P07141 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf1P07141 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf1P07141 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf1P07141 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf1P07141 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csf1P07141 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csf1P07141 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Csf1P07141 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csf1P07141 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csf1P07141 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Csf1P07141 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csf1P07141 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csf1P07141 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms