Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-Eb1P04230 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-Eb1P04230 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-Eb1P04230 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-Eb1P04230 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-Eb1P04230 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-Eb1P04230 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-Eb1P04230 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-Eb1P04230 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-Eb1P04230 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-Eb1P04230 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-Eb1P04230 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-Eb1P04230 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-Eb1P04230 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-Eb1P04230 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms