Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01787 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01787 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01787 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01787 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01787 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01787 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01787 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01787 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01787 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01787 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01787 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01787 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01787 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01787 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01787 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01787 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01787 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01787 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01787 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01787 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01787 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01787 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01787 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01787 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01787 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01787 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01787 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01787 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01787 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01787 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01787 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01787 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01787 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01787 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01787 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01787 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01787 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01787 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01787 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01787 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01787 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01787 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01787 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01787 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01787 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01787 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01787 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01787 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01787 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01787 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01787 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01787 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01787 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01787 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01787 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01787 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01787 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01787 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01787 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01787 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01787 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms