Protein–RNA interactions for Protein: P00397

Mtco1, Cytochrome c oxidase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtco1P00397 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mtco1P00397 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mtco1P00397 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtco1P00397 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtco1P00397 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtco1P00397 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtco1P00397 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtco1P00397 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtco1P00397 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtco1P00397 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtco1P00397 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtco1P00397 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtco1P00397 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Mtco1P00397 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mtco1P00397 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Mtco1P00397 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mtco1P00397 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mtco1P00397 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mtco1P00397 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mtco1P00397 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mtco1P00397 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms