Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vti1aO89116 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vti1aO89116 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vti1aO89116 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms