Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp1O89090 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp1O89090 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp1O89090 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp1O89090 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp1O89090 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp1O89090 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp1O89090 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp1O89090 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp1O89090 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp1O89090 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp1O89090 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp1O89090 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp1O89090 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp1O89090 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp1O89090 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp1O89090 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp1O89090 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp1O89090 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp1O89090 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp1O89090 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp1O89090 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp1O89090 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp1O89090 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sp1O89090 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp1O89090 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms