Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc27a3O88561 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms