Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cops6O88545 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cops6O88545 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cops6O88545 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cops6O88545 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cops6O88545 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cops6O88545 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cops6O88545 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cops6O88545 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cops6O88545 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cops6O88545 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
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