Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dnmt3bO88509 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnmt3bO88509 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms